目前，江苏农牧科技职业学院开设的42个专业（方向）基本涵盖了农牧产业链的相关产业。约三分之一的专业为全国高职院校中最早举办，四分之一专业（方向）为全省乃至全国高职院校中独有。国家级重点建设专业6个，如饲料与动物营养专业、动物医药专业；江苏省品牌、特色专业6个，如畜牧兽医专业、动物防疫与检疫专业、动物医学专业、食品营养与检测专业、宠物养护与疫病防治等专业。
动物药学院、宠物科技学院都是我院的特色院系，其中，宠物科技学院是目前国内唯一专门培养宠物类高级技术技能人才的特色学院，毕业生绝大多数在北京、上海、广州、杭州、深圳、南京、苏州等发达的大中城市就业，而且收入十分不错。
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